Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CTF1Q16619 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms