Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRRQ15256 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRRQ15256 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms