Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRMP28827 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRMP28827 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRMP28827 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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