Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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