Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NEDD8-MDP1E9PL57 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms