Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms