Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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