Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SS18Q15532 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
SS18Q15532 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SS18Q15532 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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