Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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