Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms