Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EXOSC2Q13868 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EXOSC2Q13868 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms