Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms