Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHAF1AQ13111 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms