Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
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