Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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