Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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