Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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CIPCQ9C0C6 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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