Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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CCDC96Q2M329 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CCDC96Q2M329 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CCDC96Q2M329 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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CCDC96Q2M329 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC96Q2M329 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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