Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms