Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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