Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RUNX2Q13950 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.1 ms