Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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