| RUNX3 | Q13761 | AL021997.2-201 | ENST00000615674 | 271 nt | BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MALAT1-210 | ENST00000617489 | 318 nt | TSL 2 BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091905.2-201 | ENST00000623143 | 306 nt | BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589740.1-204 | ENST00000634677 | 630 nt | TSL 4 BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MMP16-201 | ENST00000286614 | 11558 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAP3K19-203 | ENST00000375845 | 4369 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELAVL4-206 | ENST00000371827 | 3775 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASK-207 | ENST00000421587 | 8204 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ORC4-216 | ENST00000540442 | 6472 nt | TSL 2 BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ORMDL1-201 | ENST00000325795 | 2692 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC123767.1-201 | ENST00000519537 | 1439 nt | TSL 5 BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRL3-202 | ENST00000504896 | 4816 nt | TSL 5 BASIC | 4.46 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HERC4-205 | ENST00000412272 | 4211 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC35A1-201 | ENST00000369552 | 1851 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF429-209 | ENST00000618549 | 1889 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDR89-201 | ENST00000267522 | 1687 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TET2-203 | ENST00000380013 | 9679 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092821.1-201 | ENST00000640129 | 4180 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | CTAGE5-208 | ENST00000553352 | 3441 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH9-203 | ENST00000456367 | 5072 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10K1-203 | ENST00000641432 | 3775 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU1-14P-201 | ENST00000362759 | 152 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP235-201 | ENST00000410662 | 305 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010163.2-201 | ENST00000416341 | 381 nt | TSL 2 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC092484.1-201 | ENST00000420548 | 833 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC062016.2-201 | ENST00000420950 | 676 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z74021.1-201 | ENST00000423610 | 407 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157831.1-201 | ENST00000426134 | 473 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P57-201 | ENST00000432182 | 261 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LBX1-AS1-202 | ENST00000434878 | 418 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | PDCD10-206 | ENST00000470131 | 1026 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P129-201 | ENST00000491732 | 478 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL132838.2-201 | ENST00000492041 | 314 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024579.1-201 | ENST00000503685 | 371 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP519-201 | ENST00000516480 | 119 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF4A2P3-201 | ENST00000525903 | 1055 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MED28P5-201 | ENST00000528254 | 438 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB109F-202 | ENST00000542600 | 509 nt | TSL 2 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | G2E3-AS1-201 | ENST00000548631 | 579 nt | TSL 3 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355112.1-201 | ENST00000550309 | 1236 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL731537.2-201 | ENST00000561565 | 951 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093484.5-201 | ENST00000585048 | 304 nt | TSL 3 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFP30-209 | ENST00000589018 | 444 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011524.1-201 | ENST00000590167 | 240 nt | TSL 3 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011477.2-201 | ENST00000590697 | 921 nt | TSL 2 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022916.3-201 | ENST00000592961 | 742 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354984.3-201 | ENST00000604803 | 325 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099676.1-201 | ENST00000608886 | 657 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL392048.1-201 | ENST00000613946 | 534 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC034229.5-201 | ENST00000624258 | 185 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000720.1-201 | ENST00000625091 | 483 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01358-205 | ENST00000625548 | 874 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC5A12-202 | ENST00000396005 | 6250 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFAP70-201 | ENST00000310715 | 3703 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027228.2-201 | ENST00000567141 | 2154 nt | BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EMSY-207 | ENST00000525919 | 4074 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF568-214 | ENST00000616085 | 3542 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH15-212 | ENST00000395442 | 2970 nt | TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDH10-201 | ENST00000264463 | 3438 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM71-210 | ENST00000523829 | 1974 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD200R1-204 | ENST00000471858 | 3679 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR99AHG-219 | ENST00000619222 | 3476 nt | TSL 2 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360270.1-201 | ENST00000440689 | 2359 nt | TSL 2 BASIC | 4.45 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLCB4-204 | ENST00000378501 | 5833 nt | APPRIS P4 TSL 5 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FOXP2-220 | ENST00000634411 | 4065 nt | TSL 5 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NADK2-203 | ENST00000397338 | 3614 nt | TSL 2 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IRAK1BP1-204 | ENST00000607739 | 1387 nt | TSL 2 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP42P1-201 | ENST00000507474 | 1976 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LIX1-201 | ENST00000274382 | 4026 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02432-202 | ENST00000509161 | 2839 nt | TSL 2 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IQCB2P-201 | ENST00000401788 | 1633 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLYAT-201 | ENST00000278400 | 1150 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP7A1-201 | ENST00000301645 | 2950 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5K1-201 | ENST00000332650 | 1097 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP224-201 | ENST00000364140 | 325 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1orf146-201 | ENST00000370373 | 871 nt | TSL 5 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097374.1-203 | ENST00000400783 | 485 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETP15-201 | ENST00000412724 | 337 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512504.1-201 | ENST00000415494 | 778 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR13Z1P-201 | ENST00000416141 | 834 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356095.1-201 | ENST00000417217 | 199 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL159174.1-202 | ENST00000425588 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL117339.2-201 | ENST00000430475 | 180 nt | BASIC | 4.44 | □□□□□ -1.7 | | |