Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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PTPRCP08575 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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PTPRCP08575 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PTPRCP08575 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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PTPRCP08575 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PTPRCP08575 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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