Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ap4s1Q9WVL1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms