Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLKQ9UBT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLKQ9UBT6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms