Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms