Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms