Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms