Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab11fip1Q9D620 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Rab11fip1Q9D620 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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