Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins2Q9D600 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins2Q9D600 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms