Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PudpQ9D5U5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms