Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx20Q9D2Y5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx20Q9D2Y5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms