Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms