Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srfbp1Q9CZ91 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms