Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rer1Q9CQU3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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