Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkp2Q9CQ73 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms