Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGIP1Q9BQI5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGIP1Q9BQI5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms