Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ALS2Q96Q42 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms