Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx5Q8K1E0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms