Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9F4

Gm9949, Predicted gene 9949, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9949Q8C9F4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm9949Q8C9F4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm9949Q8C9F4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm9949Q8C9F4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm9949Q8C9F4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm9949Q8C9F4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9949Q8C9F4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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