Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms