Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BP99 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8BP99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8BP99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Q8BP99 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8BP99 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8BP99 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8BP99 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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