Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Necab1Q8BG18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms