Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms