Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rpl35Q6ZWV7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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