Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dtx4Q6PDK8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms