Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt40Q6IFX3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt40Q6IFX3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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