Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sycp1Q62209 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms