Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms