Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lamb3Q61087 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms